A DNS izolátumokból DNS könyvtárakat készítünk manuális, vagy robotra optimalizált módszerrel. A könyvtárkészítés során a DNS fragmenseket mintánként egyedi molekuláris azonosítókkal, bárkódokkal látjuk el, illetve kémiai úton javítjuk a DNS-ben postmortem bekövetkező változásokat. Ezután a DNS könyvtárakat sokszorosítjuk (amplifikáljuk), és előkészítjük az újgenerációs szekvenálásra (NGS), ami során meghatározzuk az örökítőanyagot felépítő és genetikai információt hordozó nukleotidok (kémiai építőkövek) sorrendjét. Vizsgálati céljainktól függően a hibridizációs befogás (target capture) módszerével „kiválogatjuk” a számunkra érdekes DNS régiókat (teljes mitokondriális genom, egypontos nukleotid polimorfizmusok) a mintákból, vagy random „shotgun” szekvenálást végzünk.
DNA amplification
From DNA extractions, DNA libraries are prepared manually or using robotic technology. During DNA library preparation, DNA is chemically repaired, and samples are barcoded with individual adapters. After amplification, the samples are prepared for next-generation sequencing (NGS), which determines the order of nucleotides (chemical building blocks) in the genetic material carrying genetic information. Depending on our research objectives, DNA regions are selected (whole mitochondrial genome, single nucleotide polymorphisms) from the samples using the method of target capture, or random “shotgun” sequencing is performed.
